این موزه در سال 1359 آغاز بکار کرد و امروز با داشتن بیش از 12 هزار اثر از 1310 شهید آماده بازدید علاقه مندان است.
در گالری دانش آموزی این موزه فضای جبهه و جنگ بازسازی شده و نگارستانی از آثار تجسمی هنرمندان با موضوعات مربوط به ایثار و شهادت به نمایش در آمده است.
در سالن شهدای ترور، آثار این شهدا از جمله وسایل شخصی و لباس های آنان که هنگام شهادت بر تن داشته اند، نظر هر بیننده ای را به خود جلب می کند.
آثار شهدای قبل از انقلاب از جمله رئیسعلی دلواری و میرزا کوچک خان و شهدای دوران انقلاب مانند شهید نواب صفوی و شهدای پس از پیروزی انقلاب در این مجموعه گرد‌آوری شده است.
در بخش دیگری از این موزه نیز آثار فرماندهان شهید سپاه و ارتش و از جمله دست نوشته هایی از شهید همت و شهید صیاد شیرازی دیده می شود. همچنین در این موزه سالن هایی برای نمایش آثار شهدای اقلیت های دینی و شهدای استان ها در نظر گرفته شده است.
در آرشیو اسناد موزه، آثار و اسناد مکتوب از جمله وصیت نامه، تالیفات شخصی و دست نوشت های شهدا نگهداری می شود.
در آرشیو البسه، آثار الیافی مانند لباس شخصی، ‌لباس رزم و چفیه شهدا بر اساس اصول ایمنی و تخصصی نگهداری می شود.
استفاده از کتابخانه تخصصی ایثار و شهادت و سایت مجازی گنجینه شاهد و ایثار گر در این موزه نیز برای عموم آزاد است.
کارگاه مرمت نیز برای ترمیم لباس رزم شهدایی که به دلیل آغشته بودن به خون به مرور زمان نسوج آن از هم گسسته شده و آن بخش از لباس ها که به دلیل اصابت ترکش آسیب دیده تاسیس شده است.
این موزه واقع در خیابان طالقانی، نبش خیابان شهید موسوی همه روزه از ساعت 8 تا 18 آماده بازدید علاقه مندان است.